Die Arbeitsgruppen der ÖGH beschäftigen sich mit den unterschiedlichsten Fachbereichen. Ziel der Gruppen ist es die verschiedenen herpetologischen Fachbereiche der Öffentlichkeit in Form von Tagungen, Führungen und Vorträgen näher zu bringen, Projekte durchzuführen und Exkursionen anzubieten. Interessierte ÖGH-Mitglieder haben die Möglichkeit den einzelnen Gruppen beizutreten.